擬將工程所涉及的約200m走廊區域及線路途經的雙溪村區域調出自然保護區管理范圍,同時將與自然保護區北部相連、生物多樣性高、生態系統完整、保護價值較高的三坤區域調入自然保護區范圍,調增面積388.8 公頃。